1.低温保存：微生物以及化学反应都需要有适宜的温度，当温度降低时，微生物活动受到抑制，食物中的脂肪氧化、维生素分解等反应速度也变慢，就可以起到保存食物、延长保质期的作用。日常应用电冰箱来冷藏或冷冻食品就是采用了这种方法。
2.脱水与干燥保存：微生物的生长繁殖和人类一样，也离不开水，当食物原料中水分降低到一定比例以下，就能抑制微生物的活动，有助于食物的贮存，肉干、红薯干和很多脱水蔬菜都是通过这种方法实现长期储存的。
3.高渗透压保存：生活中常见的腌制与糖渍，就是利用高浓度的食盐或糖提高渗透压并降低水分活度，从而抑制微生物的生长繁殖。各种腌肉、酱菜、咸菜、果脯、蜜饯都是采用了这种保存方法。
4.发酵保存：微生物的迅猛繁殖，虽然会导致食品品质的改变，然而这种改变并不一定完全是有害的，有些是有益的。发酵保存就是利用各种条件促使有益微生物生长，从而抑制有害微生物生长，不仅可以预防食品腐败变质，同时还能保持、甚至于改善食品原有营养成分和风味。果酒、果醋、乳酸饮料、泡菜、酸菜等食品就是利用这种方法进行保藏的。